É um procedimento minimamente invasivo, seguro, rápido e que não causa dor ao animal.
O endoscópio é um tubo flexível de alta tecnologia que possui uma câmera iluminada em sua ponta. O tubo é introduzido pela boca do pet e investiga a saúde de toda a parte superior do tubo digestivo, incluindo esôfago, estômago e parte do duodeno. Esse procedimento é chamado de endoscopia ou esofagogastroduodenoscopia. Para avaliação da parte final do intestino reto, intestino grosso e parte do íleo, o tubo é introduzido pelo reto e o procedimento é chamado de colonoscopia.
Todo o trajeto percorrido pelo aparelho é visualizado externamente em um monitor.
Para o procedimento, o paciente é submetido a anestesia geral, visando a um maior conforto e precisão no diagnóstico. Os exames de imagem complementares são outra parte importante do procedimento. Antes da endoscopia, o médico veterinário poderá solicitar a realização de ultrassonografia ou de radiografia torácica e abdominal e exames de avaliação pré-anestesia.